PhD-positie in extractie en bioinformatica-ontwikkeling om een diagnostisch platform te bouwen

1 - Werken bij de VUB

De Vrije Universiteit Brussel staat al meer dan 50 jaar voor vrijheid, gelijk(waardig)heid en verbondenheid, en dat leeft sterk op onze campussen bij zowel studenten als personeel.

Bij de VUB vind je een diverse verzameling aan persoonlijkheden: innovators pur sang, maar vooral mensen die 100% hun authentieke zelf zijn. Met zo’n 4.000 medewerkers zijn we de grootste Nederlandstalige werkgever, in de privésector, in Brussel; een internationale stad waarmee we ons maar al te graag verbinden en waar(rond) onze 4 campussen gelegen zijn. 

Voeg daarbij ons beginsel van vrij onderzoek - waarin zelfreflectie, een kritische houding en een open, creatieve geest rond wetenschappelijke en maatschappelijke vraagstukken centraal staan - en je hebt een universiteit die fundamenteel grensverleggend en pionierend is op het vlak van onderwijs en onderzoek. Kortom: de VUB ten voeten uit. 

De VUB is bovendien lid van EUTOPIA, een alliantie van gelijkgestemde Europese universiteiten, allen klaar om zichzelf opnieuw uit te vinden. 

2 - Functie

Momenteel zijn we voor de Onderzoeksbursalen van de Faculteit Wetenschappen en Bio-ingenieurswetenschappen, vakgroep Computerwetenschappen, op zoek naar een doctoraatsbursaal.

Meer concreet zal je takenpakket, ter voorbereiding van een doctoraat, er als volgt uitzien:

De Universitair Ziekenhuis Brussel (UZB) en de Vrije Universiteit Brussel (VUB) zijn op zoek naar een zeer gemotiveerde PhD-kandidaat om deel te nemen aan het interdisciplinaire FWO-SBO-gefinancierde project ANTICIPATE (Artificial Intelligence and Epidemic Modeling to Prepare Hospitals for the Next Respiratory Pathogen with Pandemic Potential).

Project Overzicht

De COVID-19-pandemie heeft kritieke tekortkomingen blootgelegd in onze capaciteit om opkomende respiratoire virussen te detecteren en er adequaat op te reageren. ANTICIPATE pakt deze uitdagingen aan AI-gestuurde tools en epidemiologische modellen te ontwikkelen om (1) nieuwe pathogenen vroegtijdig te detecteren via brede genomische screening en (2) ziekenhuizen te ondersteunen bij het beperken van de impact van pandemieën door middel van geoptimaliseerde besluitvorming en dataverzamelingsstrategieën.

Het project brengt experts op het gebied van kunstmatige intelligentie, epidemiologie, gezondheidseconomie, moleculaire diagnostiek en volksgezondheid samen. Het is opgebouwd rond zes wetenschappelijke werkpakketten en drie praktijkcases (UC's), met continue input van een brede adviesraad van ziekenhuizen, overheidsinstanties en zorginstellingen.

Focus van het PhD-project: Ontwikkeling van een extractieprocedure en een diagnostisch platform

Je zal verbonden zijn aan de afdeling Klinische Biologie/Microbiologische Ziekten van het UZ Brussel, het sequencingplatform BRIGHTcore en het AI Lab van de VUB. Je speelt een sleutelrol in de ontwikkeling van een nieuw AI-gestuurd diagnostisch platform voor de detectie van nieuwe aandoeningen. Luchtwegpathogenen. Door nieuwe pathogenen sneller te kunnen detecteren, kan sneller worden gereageerd. Taken omvatten: ten eerste de ontwikkeling van een extractieprocedure voor verzamelde luchtwegmonsters en ten tweede de ontwikkeling van een genomisch diagnostisch platform voor de detectie van voorheen onbekende virussen.

Wat wij bieden

Een volledig gefinancierde vierjarige PhD-positie binnen een dynamisch en interdisciplinair onderzoeksconsortium. Toegang tot rijke klinische datasets, geavanceerde modelleringstools en realistische ziekenhuisinfrastructuur. Mogelijkheden voor internationale samenwerking, training en verspreiding. Een levendige academische omgeving op het snijvlak van AI, volksgezondheid en klinisch onderzoek.

Voor deze functie zal onze Brussels Humanities, Sciences & Engineering Campus (Elsene) je thuisbasis worden. 

3 - Profiel

Wat verwachten wij van jou?

• Masterdiploma in biomedische wetenschappen, volksgezondheid, biostatistiek, bioinformatica, epidemiologie of een gerelateerd vakgebied

• Ervaring met bioinformatica en computationele benaderingen.
• Sterke interesse in AI, modellering van infectieziekten, datagestuurde gezondheidszorg en interdisciplinair onderzoek.
• Ervaring met data-analyse (bijv. R, Python) en/of klinisch databeheer is een pluspunt.
• Uitstekende communicatieve vaardigheden in het Engels. Kennis van het Nederlands is een troef voor werken in een klinische setting.
• Samenwerkingsgerichte mentaliteit en de motivatie om bij te dragen aan impactvol, maatschappelijk relevant onderzoek.

• Je hebt geen werkzaamheden verricht in het kader van een mandaat als assistent bezoldigd ten laste van de werkingsmiddelen, gedurende meer dan 12 maanden (gecumuleerd). 

VUB wil een weerspiegeling zijn van de maatschappij waar ieders talent wordt gewaardeerd, ongeacht het gender, geslacht, leeftijd, religie, huidskleur, migratieachtergrond, functiebeperking en de neurodiversiteit.

4 - Aanbod

Word jij onze nieuwe collega?

Dan bieden we je een voltijdse doctoraatsbeurs aan, voor de duur van 12 maanden (verlengbaar tot max. 48 maanden, mits positieve evaluatie van de doctoraatswerkzaamheden), met voorziene startdatum 01-10-2025.

Je ontvangt een beursbedrag gekoppeld aan een van de barema’s die door de overheid worden vastgelegd.

OPGELET: De effectieve uitwerking van de doctoraatsbeurs is onderworpen aan de opschortende voorwaarde van jouw inschrijving als doctoraatsstudent aan de universiteit.

Bij de VUB garanderen we een open, betrokken en diverse werkplek en bieden we je kansen om je carrière (verder) uit te bouwen.

Daarnaast geniet je van voordelen als:

• Uitgebreide thuiswerkmogelijkheden, een telewerkvergoeding van 50 euro per maand OF een internetvergoeding van 20 euro per maand; 
• Een open informele werkomgeving met aandacht voor je work-life balance, een uitzonderlijke verlofregeling met 35 verlofdagen (bij voltijdse tewerkstelling), sluiting tussen Kerstmis en Nieuwjaar, en 3 extra verlofdagen; 
• Een kosteloze hospitalisatieverzekering; 
• Maximale terugbetaling van woon-werkverkeer met het openbaar vervoer en/of een fietsvergoeding; 
• Gevarieerde maaltijden in onze campusrestaurants aan een aantrekkelijk tarief; 
• Voordelige sportmogelijkheden, een gamma aan kortingen via Benefits@Work (in allerlei winkels, op vluchten, in tankstations, pretparken...) en Ecocheques; 
• Kinderdagverblijf vlak bij de campus, korting op vakantiekampen; 
• De ruimte om je job-inhoud mee te vormen en voortdurend bij te leren via onze VUB-leerplatformen en opleidingen; 
• En tot slot: toffe collega's met een gezonde drive.

5 - Geïnteresseerd?

Spreekt deze functie je aan?

Stel je dan kandidaat, ten laatste op 31-08-2025, via jobs.vub.be, en laad volgende documenten op: 

• je motivatiebrief; 
• je curriculum vitae; 
• je diploma’s (niet van toepassing voor VUB-alumni).

Ons sollicitatieproces ziet er als volgt uit (onder voorbehoud van wijzigingen):

• stap 1: een eerste selectie op basis van je sollicitatiedossier; 
• stap 2: een job-interview. 

Heb je vragen over deze functie? Contacteer dan Pieter Libin via pieter.libin@vub.be of 0473844993. 

Wil je graag weten hoe het is om te werken bij de VUB? Ga dan naar jobs.vub.be, en ontdek alles over o.a. onze campussen, voordelen, strategische doelen en collega’s.

Wil je meer info over EUTOPIA? Ga dan naar eutopia-university.eu, en kom meer te weten over ons Europees netwerk van universiteiten.